影响呼吸作用的因素有温度、氧气浓度、二氧化碳浓度、含水量等，其中主要是温度。现在简单谈谈这些因素的影响及其在生产实践中的应用。

1、温度

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呼吸作用在最适温度(25℃~35℃)时最强;超过最适温度，呼吸酶活性降低甚至变性失活，呼吸作用受抑制;低于最适温度，酶活性下降，呼吸作用受抑制。

生产上常利用这一原理在低温下储存蔬菜、水果。在大棚蔬菜的栽培过程中夜间适当降温，抑制呼吸作用，减少有机物的消耗，可达到提高产量的目的。

2、氧气浓度

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在氧气浓度为零时，只进行无氧呼吸;氧气浓度为10%以下时，既进行有氧呼吸，又进行无氧呼吸;氧气浓度为10%以上时，只进行有氧呼吸。

生活中常利用降低氧气浓度能抑制呼吸作用，减少有机物消耗这一原理来延长蔬菜水果的保鲜时间。但是，在完全无氧的情况下，无氧呼吸强，分解的有机物也较多，一样不利于蔬菜水果的保质、保鲜，所以一般采用低氧(5%)保存，此时有氧呼吸较弱，而无氧呼吸又受到抑制。

无土栽培通入空气，农耕松土等都是为了增加氧气的含量，加强根部的有氧呼吸，保证能量供应，促进矿质元素的吸收。

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3、二氧化碳浓度

CO₂是呼吸作用产生的，从化学平衡角度分析，CO₂浓度增加，呼吸速率下降。

在密闭的地窖中，氧气浓度低，CO₂浓度较高，抑制细胞的呼吸作用，使整个器官的代谢水平降低，有利于保存蔬菜水果。

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4、含水量

呼吸作用的各种化学反应都是在水中进行的，自由水含量增加，代谢加强。

粮油种子的贮藏，必须降低含水量，使种子处于风干状态，从而使呼吸作用降至最低，以减少有机物消耗。如果种子含水量过高，呼吸作用加强，使贮藏的种子堆中温度上升，反过来又进一步促进种子的呼吸作用，使种子的品质变坏。